大卫·杜楚尼,吉莲·安德森,
联邦调查局学院的女性法医黛娜•斯科莉(Gillian Anderson 吉莲•安德森 饰)是一名理性的科学工作者,她坚信一切神秘事件都有科学合理的解释。而FBI总部负责X档案的福克斯•穆德(David Duchovny 大卫•杜楚尼 饰)则是个喜欢追逐不可思议事件的怪人。相关官员为此派斯科莉协助穆德,以期改变穆德的思维模式。
两人初次见面即针锋相对,穆德带斯科莉前往俄勒冈州,调查一起高中生离奇死亡的案件。经验尸,穆德断定这是外星人制造的绑架案,期间更向斯科莉袒露了妹妹萨曼莎被劫持的过去。两人的关系初步缓和,但他们的调查却阻碍重重……